Det mandlige kønsorgan består af både ydre og indre dele. De eksterne mandlige kønsorganer inkluderer penis, urethra og pungen. De interne mandlige kønsorganer inkluderer sædblæren, testikler, vas deferens, epididymis, prostata, bulbourethral kirtel og ejakulatorisk kanal.
Penisen er hoveddelen af eksterne mandlige kønsorganer, der har både seksuelle og kropslige funktioner. Det er i stand til at ejakulere sæd (indeholdende sædceller) under sex og lindre kroppen af urin. Urinrøret transporterer urinen fra blæren ud af den mandlige krop. Sæd rejser også gennem urinrøret.
Hver mand har to scrotale poser, som huser visse dele af det indre mandlige kønsorganer (epididymis, testikler og nedre sædceller). Testiklerne er den vigtigste del af indre mandlige kønsorganer, fordi de fremstiller og opbevarer sædceller samt forsyner den mandlige krop med hormoner, der kontrollerer udviklingen af mandlige egenskaber og reproduktionsorganer.
Epididymis opbevarer, modnes og transporterer sædceller mellem testiklerne og vas deferenserne, som kanaliserer sædceller mod urinrøret. Seminalvesiklerne støder op til urinrøret og udskiller en mælkeagtig væske, der i sidste ende udledes gennem udløsningskanalen. De bulbourethrale kirtler hjælper også med udledningen af sæd.
